「準備圖樣的第一步就是確定圖形組件的理想尺寸,例如病毒殼體的直徑及棘蛋白的長度。 在SARS-CoV的低溫電子顯微鏡下的結構(引用自Neuman... 等等,2006),病毒顆粒的直徑範圍從82-94nm,不包括棘蛋白。 根據這個證據,我們使用3D CAD軟體Rhinoceros (McNeel)對直徑為88nm的球形病毒顆粒進行建模。蛋白質對蛋白質的相互作用(PPI)在許多生物程序中扮演關鍵作用,並且是藥物進行探索活動時非常有趣的目標。 實驗及計算技術的進步讓數據的可存取性增長,隨之而來的是對PPI分析需求的增加。 在這方面,視覺化工具是用來表現並和分析生物分子相互作用的重要工具!
在根據病毒殼體測量值88nm適當調整大小之後,在同一論文中所呈報的電子顯微鏡影像上測量棘蛋白長度:縱向大小確定為大約12.40 nm。
然後在Rhinoceros軟體(Rhino 7),以所有的維度函數之下的Scale(尺寸)進行圖像縮放。」
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